育秧盘是幼苗生长发育的场所而基质则是为幼苗提供营养来源的主要供应场所是穴盘的主要来源。育苗基质的基本要求工厂化育苗的基本基质材料有珍珠岩、草炭(泥炭)、蛭石等。国际上常用草炭和蛭石各半的混合基质育苗，我国一些地区就地取材，选用轻型基质与部分园土混合，再加适量的复合肥配置成育苗基质。但机械化自动化育苗的基质不能加田土。

    穴盘育苗基质的总体要求是尽可能使幼苗在水分、氧气、温度和养分供应得到满足。影响育苗基质理化性状主要有：基质的pH值、基质的阳离子交换量与缓冲性能、基质的总孔隙度等。有机基质的分解程度直接关系到基质的容重、总孔隙度以及吸附性与缓冲性，分解程度越高，容重越大，总孔隙度越小，一般以中等分解程度的基质为好。

    不同基质的pH值各不相同，泥炭的pH值为4.0～6.6，蛭石的pH值为7.7，珍珠岩的pH值为7.0左右，多数蔬菜、花卉幼苗要求的pH值为微酸至中性。阳离子交换量是物质的有机与无机胶体所吸附的可交换的阳离子总量，高位泥炭的阳离子交换量为1400～1600mmol/千克，浅位泥炭为700～800mmol/千克，腐殖质为1500～5000mmol/千克，蛭石为1000～1500mmol/千克，珍珠岩为15mmol/千克，沙为10～50mmol/千克。